如果夫妻双方都有借款，并且逾期不还，借款机构可以申请法院进行财产保全措施，包括对夫妻双方的财产进行冻结或查封。这其中，是否会冻结夫妻双方的财产，则取决于具体的司法裁判。一般情况下，夫妻共同所有的财产有可能被冻结，但如果财产明显归属于其中一方，则不太可能被冻结。值得注意的是，冻结夫妻共同财产可能会影响家庭经济状况，因此建议夫妻在借款前积极沟通，共同维护家庭的经济稳定。
在借款合同中，通常会约定借款人的还款义务和相关的逾期罚款条款。如果借款人未能按期履行还款义务，根据合同条款，借款人可能需要支付逾期罚款，并可能面临法律诉讼。
在极端情况下，法院可能会发出冻结财产的判决令，以保证借款人还款的安全性。然而，法院的判决通常不是随意做出的，而是在具体的情况下根据法律和实际情况做出的。因此，夫妻双方的财产是否被冻结取决于具体情况，需要在法律程序中进行判断或解决。