这需要视情况而定。
1.发不出芽的大豆基本上是因为它们已经死掉了，和转基因没有什么关系。大豆作为一种高脂肪高蛋白的种子，发芽率随着时间下降的很快。如果对生豆芽感兴趣，不妨去田间地头直接搞点最新的大豆，那就会非常容易的发出豆芽。
2.转基因作物主要是认为导入了一些抗虫抗病基因，可能对生态产生非常严重的污染，再就是导入的基因经过变异或者基因重组产生新的未知表达产物，危险性未知，发芽应该是没有问题。
目前没有官方报道证明转基因大豆不能做豆腐。转基因大豆是通过转基因技术将某些特定的基因转移到大豆中，从而改变大豆的遗传特性，使其具有更好的品质和抗性。
豆腐是一种传统的豆制品，通常由大豆、水和凝固剂（如石膏、内酯等）制成。转基因大豆与普通大豆的成分基本相同，都含有蛋白质、脂肪、膳食纤维、维生素和矿物质等营养成分。因此，用转基因大豆制成的豆腐在营养成分和口感上与普通豆腐没有明显区别。
不过，转基因大豆在种植和加工过程中可能会使用一些化学物质和农药，这些物质可能会对人体健康产生影响。因此，在选择豆腐时，建议选择来源可靠、符合食品安全标准的豆腐，以确保食品安全和健康。
一、因为有些基因工程育种还采用了杂交技术。有些转基因育种将目的基因转到特定品种，创造出新的种质资源后，再通过杂交手段与其它品种杂交，从而将多个品种性状集中到一个新材料里。就象马和驴杂交的后代骡子，有马的力气和驴的耐力。在农业上，杂交玉米的种子第二年再次种植，会由于杂种优势的消失以及性状分离，产量不如上一年而且抗病虫害能力也会下降。因为转基因种子往往是杂交种子，所以才不适合留种。所以，发不发芽不能作为判断转基因的标准。
二、将黄豆完全浸没在水中，看到不发芽就认为是转基因的，这种判断方法和检测标准都不正确。黄豆始终泡在水里是没办法出芽的，也不能用是否发芽作为判断转基因作物的标准。我国要求进口转基因大豆只能加工豆油和饲料豆粕，并且有明确的标识管理措施，要求含转基因成分必须标注。因此，消费者可以在正规渠道放心采购，注意阅读包装上的标签即可。