快递公司内部罚款不合法。因为该公司不具有罚款的权利。但若劳动者因本人原因导致公司遭受损失的，可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
经济损失的赔偿，可以保留当地最低工资标准为限，从劳动者本人的工资中扣除。
快件延误、丢失、损毁或者内件短少的，对保价的快件，应当按照经营快递业务的企业与寄件人约定的保价规则确定赔偿责任；对未保价的快件，依照民事法律的有关规定确定赔偿责任。
冒领、私自开拆、隐匿、毁弃、倒卖或者非法检查他人快件，尚不构成犯罪的，依法给予治安管理处罚。
经营快递业务的企业有前款规定行为，或者非法扣留快件的，由邮政管理部门责令改正，没收违法所得，并处5万元以上10万元以下的罚款；情节严重的，并处10万元以上20万元以下的罚款，并可以责令停业整顿直至吊销其快递业务经营许可证。
若是消费者碰到快递不经自己的同意就被私自存放到快递驿站的问题，投诉的方法是致电12305、12315、12345热线去投诉，这些部门都可以受理快递方面的投诉。
监管部门收到投诉后会查明情况，如果情况属实，小则进行罚款，重则停业整改。